輝瑞研發AI平台　可預測蛋白質結合作用加速藥物開發

記者／竹二

人工智慧與機器學習在醫學上的應用越來越廣泛，近日輝瑞與奧地利科學院分子醫學中心發表了一款AI平台，可以預測數百個小分子如何將數千種人類蛋白質相結合和相互作用，並發現2000多種目前還沒有開發成藥物靶點的蛋白質，未來對於藥物開發的幫助大。

藥物靶向蛋白質只占20%成藥物開發盲點

根據該研究團隊的說法，市面上有超過90%的藥物是小分子或配體，大多都是透過與蛋白質結合發揮作用，但他們發現，這些藥物靶向的蛋白質只占人類蛋白質的20%，這讓藥物開發產生許多盲點，因此他們耗時3年研究，開發出這款AI平台，運用化學蛋白質體學中的化學探針小分子化合物，來了解小分子如何與蛋白質相結合。

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研究團隊透過研究結果，開發出可靶向3種不同標靶的合成配體，驗證了該方法具有轉譯潛力，他們在運用這些數據建構出一個機器學習模型，可以深入預測小分子會結合多少不同的蛋白質，以及與這些蛋白質結合的困難度，該模型還可以預測配體是否可以與同類型蛋白質進行相互作用，像是RNA結合蛋白、運輸蛋白，或是細胞中特定位置的蛋白質。

AI平台可預測小分子片段與蛋白質作用

這項研究產生的蛋白質體庫將為藥物開發和生物醫學研究開啟新的大門。研究人員指出，小分子片段與蛋白質的相互作用預測模型，可以加快發現目前尚未開發成藥物靶點的蛋白質，對於未來藥物開發的幫助大。研究人員也提到，未來他們將會增強AI和模型的訓練資料集，希望可以超越蛋白質體，進一步研究小分子片段如何與RNA等核酸相互作用。

據悉，這項研究發表於《Science》並開放Al模型及數據給所有研究人員使用，是目前最大的配體發現入口網站。

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