DeepMind打造AI模型AlphaProteo 有望加速癌症、糖尿病新藥發現
記者／彭夢竺
Google DeepMind近日宣布，他們打造了一款AI模型AlphaProteo，可以用來生成蛋白結合劑（Binder），與多種標靶蛋白高度親和。根據DeepMind團隊的說法，AlphaProteo可生成與癌症和糖尿病併發症相關的VEGF-A蛋白結合劑，是第一款能做到這件事的AI模型。
AlphaFold可預測蛋白質結構
DeepMind表示，體內的每個生物過程，從細胞生長到免疫反應，都取決於蛋白質分子之間的相互作用，就好像一把鎖的鑰匙一樣，蛋白質之間可以互相結合，幫助調節關鍵的細胞過程，AlphaFold這樣的蛋白質結構預測工具讓人們深入了解蛋白質如何相互作用以執行功能，但這些工具無法創建新的蛋白質來直接操縱這些相互作用。
就模型本身來說，AlphaProteo是以大量的蛋白質結構數據訓練而成，這些數據來自蛋白質數據庫（PDB）和1億多個AlphaFold產出的預測結構，DeepMind團隊用這些數據讓模型學習蛋白質相互結合的過程。
AlphaProteo可生成生成蛋白結合劑
訓練完後進行測試，AlphaProteo針對7種標靶蛋白以及5種與癌症、發炎和自體免疫疾病有關的蛋，來生成這些蛋白的結合劑，與現有最佳方法相比，AlphaProteo生成的結合劑成功率更高，結合親和力甚至高出3到300倍。
DeepMind指出，這些新型蛋白結合劑在實際應用中，更有可能成功結合到標靶蛋白上，對於癌症和糖尿病等疾病治療有潛在的應用價值，可用於新藥發現和生物感測器開發領域。
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