AI預測蛋白質結構變化 中國藥物研發重大突破
編譯／莊閔棻
開發可以預測蛋白質結構變化的人工智慧（AI）非常複雜，人們甚至認為機器可能無法完成這項任務。但是，現在中國科學家表示，他們已經實現了「不可能」，成功開發了一個可以預測蛋白質構象的AI模型。
根據《南華早報》的報導，一幫中國科學家成功開發了可以預測蛋白質結構變化的AI，而這一突破可以加快臨床前藥物開發過程。
作為人體組成的一部分，由長鏈胺基酸組成的蛋白質的三級結構，會根據所需的生物學功能，導致蛋白質發生可逆變化，而這些替代結構被稱為「構象」。而所謂的「蛋白質構象病（proteopathy）」就是指當某些蛋白質的結構變得異常，造成身體細胞、組織和器官的功能被破壞而導致的疾病。
著名結構生物學家顏寧就曾表示，在藥物開發中，要理解蛋白質構象還存有局限性。但是現在，西湖大學工程學院教授李子卿和其團隊表示，他們的 AI 模型 ProtMD 克服了這個問題，而且可以準確預測蛋白質在不同生理環境中會形成哪些構象。
李子卿說：「在我們之前，沒有人能夠預測蛋白質結構的動態變化。即使是 DeepMind 開發的最強大的 AlphaFold2，也只能在瞬間預測蛋白質的靜態結構」。李子卿提到，ProtMD不但可以根據蛋白質的先前狀態預測即將變成的構象，還可以預測與藥物分子相互作用後的構象變化，讓人們有機會對藥物的作用進行評估。
他說，這項研究是使用AI方法分析蛋白質動態構象的第一步，ProtMD的基礎版已經超越了最先進的模型，而其商業級版本將進一步提高藥物親和力預測和虛擬篩選的效率。
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